Stiftet 29.september 2000.

Follo FK`s A-lag spilte i 3.div sesongen 2001, sesongene 2002, 2003 og 2004 spilte laget i 2.div. I 2004 ble det opprykk til Adeccoliga. Sesongen 2005 og 2006 var tilholdstedet Adeccoliga. I sesongen 2007 og 2008 spilte og spiller laget i 2.div. Follo FK har ikke hatt de helt store cuptradisjoner. I sesongen 2006 ble laget NM-cupens store overraskelse, etter å ha slått ut regjerende mester Molde FK i 3.runde hjemme i Ski og Sogndal på Fosshaugane i 4.runde. Begge kamper ble avgjordt etter ekstraomganger.

Follo FK`s største sportslige øyeblikk til nå er kvartfinalen i NM-cupen 2006. Kampen ble spilt mellom Follo FK og Sandefjord på Ski stadion 20.august 2006. Laget fra hvalfangerbyen vant kampen 1-0, etter scoring av Tommy Knarvik. Senere spilte Sandefjord seg helt frem til cupfinale hvor de tapte for Fredrikstad FK. 

Christian G. Petersen spilte kvartfinalen for Follo FK mot Sandefjord etter å ha blitt leid ut fra Fredrikstad FK høsten 2006. Samme Petersen ble norgesmester for FFK etter å ha spilt de tre første rundene for Østfold-laget.

Filmsnutt fra kvartfinalen mellom Follo FK og Sandefjord

Serie plassering:
2001: 1.Plass 3.div Menn avd 2 - 1.Runde NM. Slått ut av Oslo Øst
2002: 3.Plass 2.div Menn avd 1 - 1.Runde NM. Slått ut av Elverum
2003: 11. Plass 2.div Menn avd 1 - 1.Runde NM. Slått ut av Skjetten
2004: 1.Plass 2.div Menn avd 2 - 1.Runde NM. Slått ut av Lillehammer
2005: 11.Plass Adeccoligaen - 2.Runde NM. Slått ut av Strømsgodset
2006: 15.Plass Adeccoligaen - Kvartfinale NM. Slått ut av Sandefjord
2007: 5.Plass 2 div Menn avd 4 - 2.Runde NM. Slått ut av Korsvoll
2008: 6.Plass 2.div Menn avd 1 - 2.Runde NM. Slått ut av Sarpsborg
2009: 1.Plass 2.div Menn avd 2 - 2.Runde NM. Slått ut av VIF